办理食品进出口备案是一个涉及多个步骤和部门的过程，以下是根据最新信息和权威来源整理的详细流程：

一、进口食品备案流程

1. 准备材料

• 进口食品进口商备案申请表：详细填写进口商的基本信息及进口食品的相关信息。
• 组织机构设置、部门职能和岗位职责：与食品安全相关的组织机构设置情况。
• 拟经营的食品种类、存放地点：明确经营的食品种类及存放的具体地点。
• 相关说明：如2年内曾从事食品进口、加工和销售的，应提供相关说明（食品品种、数量）。

2. 提交申请

• 网上办理：登录“互联网+海关”一体化平台，进入“企业管理和”版块，点击“进口食品进口商备案”按钮，填写并提交备案信息。
• 现场办理：向各主管海关业务现场提交申请，并附上准备好的材料。

3. 审核与备案

• 海关对提交的申请材料进行审核，符合要求的予以备案并公布境内进口商名单。
• 不符合要求的，海关将退回申请，企业可以修改申请信息后重新提交。

4. 查询备案进度

• 登录备案系统查询备案进度，备案审核通过的，可查询发放的备案号。
• 审核不通过的，可查看具体原因，按要求整改后可重新提交申请。

二、出口食品备案流程

1. 准备材料

• 企业资质及证明文件：包括营业执照、生产许可证、产品质量安全标准证书等。
• 产品原产地及卫生证明：原产地证明和卫生证书，证明食品的原产地和符合卫生标准。
• 质量检验及合规性文件：由第三方检验机构出具的检验报告，证明出口货物质量合格。
• 其他文件：根据具体出口情况和进口国要求，可能需要提供特定食品的国家相关部门批件、新食品原料的证明文件、委托生产的委托加工协议等。

2. 提交申请

• 将准备好的备案申请材料提交给当地食品药品监管部门或相关部门进行备案申请。

3. 审核和验收

• 相关部门对提交的备案申请材料进行审核，包括企业资质、产品质量安全等方面的审核。
• 可能需要现场验收企业生产环境和产品质量情况。

4. 发放备案证书

• 经过审核和验收合格后，相关部门将向食品出口商发放备案证书，证明该企业已完成备案办理程序，可以进行食品出口业务。